Награжден боевыми и правительственными наградами: Орденом Отечественной Войны 2 ст., два ордена «Красной звезды», «Знаком Почета» за строительство ново-сухоложского цементного завода. Шишкин Федор Иванович – почетный гражданин города Сухой Лог. Занесен в энциклопедию «Лучшие люди России».
